醫(yī)療凈化工程在初步建設完畢之后接下來的步驟（procedure)就是進行裝修設計，特別是高級別的手術室凈化對于室內裝飾有著非常嚴格的要求，使其在滿足功能要求的前提下，減少因材料和構造而產生或積聚的塵菌（fungus)，這對預防污染、降低（reduce)術后感染率是至關重要的。潔凈手術室裝修手術室的空氣；手術所需的物品；醫(yī)生護士的手指及病人的皮膚，防止感染，確保手術成功率。要求設計合理，設備齊全，護士工作反應靈敏、快捷，有高效的工作效率。手術室要有一套嚴格合理的規(guī)章制度和無菌操作規(guī)范。隨著外科技術飛速發(fā)展，手術室工作日趨現(xiàn)代化。
層流手術室凈化地面裝修
由于地面的污染度比墻和吊頂要高得多，大量塵粒由于醫(yī)護人員在地板上的走動和各種設備的移動而產生，故地面裝修應引起設計人員的重視。層流手術室凈化采用高效低毒消毒劑，以及合理使用，是保障一般手術室無菌環(huán)境的有力措施。根據(jù)不斷討論與反復斟酌，修訂后《綜合醫(yī)院建筑設計規(guī)范》中，關于一般手術室的條文最終確定為：“一般手術室應采用末端過濾器不低于高中效過濾器的空調系統(tǒng)或全新風通風系統(tǒng)。地面裝修應做到平整、光滑、耐磨、耐侵蝕(酸、堿、藥)、易清潔。國內常采用現(xiàn)澆水磨石，取其光滑、耐磨、不起塵、防靜電(是一種處于靜止狀態(tài)的電荷)、易清洗之長，但不宜采用過氧(Oxygen)乙酸稀釋(dilute)液洗消，否則會與堿性的水泥（材料:粉狀水硬性無機膠凝材料)起反應導致麻面。
較高檔的地面裝修可選用橡膠(Rubber)、聚胺脂(polyurethane)涂料、樹脂類板材等，如在歐美、日本的許多醫(yī)療手術環(huán)境中，都采用了彈性塑膠(相關聯(lián)事物:塑料)卷材作地面材料。潔凈手術室裝修手術室的空氣；手術所需的物品；醫(yī)生護士的手指及病人的皮膚，防止感染，確保手術成功率。要求設計合理，設備齊全，護士工作反應靈敏、快捷，有高效的工作效率。手術室要有一套嚴格合理的規(guī)章制度和無菌操作規(guī)范。隨著外科技術飛速發(fā)展，手術室工作日趨現(xiàn)代化。它最顯著的優(yōu)點，就是少接縫(通常采用熱熔焊接進行卷材間的連接，焊條由與卷材相同的塑膠材料制成)，可避免污物及特殊結構:莢膜、鞭毛、菌毛（fungus)的堆積，另外，它還具有耐污易潔、腳感舒適、花紋款式多樣、安裝及更換簡便等水磨石無法比擬的優(yōu)點。
在垂直手術室凈化，如采用地面或地溝回風，回風部位面板應選用塊狀活動隔柵地板。地面不宜設地漏，否則應設高水封地漏，以防透氣污染潔凈室內空氣。
層流手術室凈化吊頂裝修
頂棚底面需布置與安裝高效過濾器(作用:過濾雜質等)送風口、照明燈具、煙感滅火器等，各種管線均需隱蔽在頂棚內，故頂棚部分是手術室凈化內部裝修的重點部位。頂棚以輕鋼龍骨及大塊面板材料做吊頂為宜，吊頂上風管等振動影響較多，故控制（control)振動脫落比控制材料表面硬度（Hardness)更重要。吊頂罩面材料宜采用密封膠灌縫或壓條密封，使之形成整體，防止吊頂上部空間的灰塵通過縫隙污染潔凈手術室的氣流。
層流手術室凈化門窗裝修
在無窗的手術室凈化工程中，醫(yī)護人員及病患者因與外界完全隔絕，都容易產生抑郁、“被監(jiān)禁”等不良感覺，不利于手術順利進行(尤其是時間較長的大型手術)。因而筆者認為，潔凈手術室可根據(jù)實際情況，適當設置窗戶，改善手術室內的環(huán)境氣氛，同時利于室外醫(yī)護人員及時了解手術情況，不必入內即可與室內人員進行溝通。
層流手術室凈化門位設置與氣流流向和手術床有很大關系，在水平層流手術室，門位設在下風向，在其他手術室，門設在病人腳的方向，可以防止進出人流對病人的影響。